659年，设立了127个州县。(通鉴载"(659年)九月，诏以石、米、史、大安、小安、曹、拔汗那、北拔汗那、悒怛、疏勒、朱驹半等国置州县府百二十七)
661年，在兴都库什山以南的16国设立了8个都督府；76个州；110个县，126个军府。
早期建制的主要地区：（前面为今地名）
塔什干：当时称为“石国”。658年已经设立了大宛都督府。
费尔干纳：当时称为“宁远”。658年设立休循州都督府。
撒马尔罕：总称为“康”。631年设立康居都督府。
米国：在撒马尔罕南部。658年设立南谧州，任命刺史（唐朝的州长叫刺史）。
卡塔-库尔干：当时称为“何国”。641年设立贵霜州，任命刺史。
乌拉-提尤加：在宁远西南四百里，当时称为东曹。唐高祖时已经归附。
沙赫里夏勃兹：当时成为“史国”，642年设立佉沙州，任命刺史。
布哈拉：古代成为“安国”，设立安息州，任命刺史。
661年的区划设置主要在阿姆河中上游及今阿富汗境内。
经过这两次建制后，唐朝在中亚南部暨阿富汗地区的主要行政区划包括：
鸟飞州都督府：主要在今瓦克汗走廊——就是阿东部与我国相连的那个长尾巴。另管辖1个州，州治所在今萨尔哈德。
至拔州都督府：在今塔吉克斯坦的达尔瓦兹地区。
天马都督府：在塔吉克斯坦的卡非尼河盆地。下辖落那与束离两州。
悦班州都督府：治所在乌兹别克斯坦的迭脑。
高附州都督府：在今阿、塔边界一带。下辖2个州。汉朝时的高附指喀布尔，与唐朝的高附州都督府位置不同。
王庭州都督府：在今塔吉克的西南角。
姑墨州都督府：治所在今乌兹别克斯坦的苏尔汉河口。
月氏都督府：治所在今阿富汗的昆都士。下辖25个州。
大汗都督府：下辖15个州。
旅獒州都督府：在今土库曼与阿富汗之间的安德胡伊一带。
奇沙州都督府：治所在今阿富汗西北的希巴干。
昆墟州都督府：在土库曼东南的木耳加河一带。
修鲜都督府：治所在今喀布尔。公元619年已向唐表示归附。管辖10个州。
写凤都督府：治所在今阿富汗的巴米扬。管辖5个州。
条支都督府：在阿富汗南部，管辖9个州。李白有诗云：“洗兵条支海上波”，因此有人认为唐朝军队可能曾越过阿富汗到达阿拉伯海边。
波斯都督府：不在伊朗，而是在今锡斯坦。阿拉伯哈里发东侵后，波斯不能抵挡，王子亲赴长安求援。唐朝册封定立三代波斯王室后裔为波斯都督，有的晋封为波斯国王，在今阿、巴、伊边境一带立国，但终于未能恢复萨珊王朝在波斯本土的王统。
此时唐帝国雄霸西域，彻底恢复了汉朝曾经在西域的疆域，甚至更加超过，因此安西都护府在西域的地位更显重要，于是帝国将安西都护府治所移节龟兹，并再升一级，成为了“安西大都护府”，龟兹（今新疆库车）、疏勒（今新疆喀什）、于阗（今新疆和田西南）、焉耆（今新疆焉耆西南）四镇为其核心，以从二品官衔的安西大都护为最高统领，号令西域。
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