战斗结束后，兴奋的唐生智连忙打电话向蒋介石报功，蒋介石得知梅村战败，宝刀复得时大喜。但是得知中国宪兵参战后不由勃然大怒，将唐生智狠狠责骂，并下令没有自己的手令，任何人都不能擅自调动中国宪兵。于是，在上层的压力下，刚刚打了胜仗的中国宪兵部队，不得不撤离雨花台，回到营房驻地。
然而，正是这个错误的决定，使得日本谍报机关得知了中国宪兵的驻地位置，从而改变了中国宪兵的命运。
当天深夜，日本空军出动轰炸机50多架，对中国宪兵的驻地展开了疯狂的轰炸，大部分战士在睡梦中被炸死，侥幸逃出者仅200人，这支国民政府倾注心血组建的王牌部队，就这样因为蒋介石的错误决定而覆灭了。
巧合的是，第二天，蒋介石向唐生智发布了撤退的命令，日军趁机占领南京，惨绝人寰的南京大屠杀开始了。
☆化整为零异国再显身手
之后，中国宪兵剩余的200多人被化整为零投放到了西南战场，参加了西南战场的大部分重要战役。特别是震惊中外的长沙会战中，正是由于中国宪兵小分队成功偷袭了日军的临时机场，才使得日军失去了制空权，为长沙会战消灭上万日寇奠定了基础。在1942年新五军入缅作战中，当部队被日军团团围困的时候，又是3名中国宪兵战士，凭借超强的生存能力穿越了日军的封锁，与英美部队取得联系，使新五军避免了全军覆没的厄运。这支部队在化整为零以后显示了强大的战斗力，并立下了卓越的功勋。但同时他们自己也损失惨重，抗战胜利以后，他们只剩下50多人，其中一半人已经因受伤而身体残疾。
1946年，国民政府重新改组中统特务组织，这些中国宪兵的剩余人员被任命为中统教官，甚至有人在渣滓洞集中营供职。1949年以后，他们中的大部分逃往台湾，少部分在解放后被镇压枪毙。逃往台湾的那一部分又很快成为了台湾特务的骨干，在解放后50多年的两岸特工战中，扮演了重要的角色。
网友黑旗军团提督补充资料一：
国民党宪兵部队在南京保卫战中担负的是清凉山守备任务，防守雨花台的是国民党88师(德式师)，在紫金山担任守备的国民党中央陆军军官学校教导总队，根据史实，守备雨花台的88师部队是单独死守雨花台核心阵地的，因为中华门在雨花台被日军占领前就被日军控制了主要阵地，雨花台的守军已经被孤立包围了~~
国民党宪兵部队应该是受命增援光华门，和国民党87师一起反击占领光华门的日军第九师团，如果我没记错的话，日军第九师团应该是谷寿夫师团~
网友黑旗军团提督补充资料二：
以下是黑旗的资料回忆~~错了请指教~
出卖中国宪兵部队驻地资料的间谍据说就是著名的川岛芳子，唉~~中国当时号称最强悍的军队竟然被一个女人动动手指头就被灭了~真是哗天下之大嫉！
在抗日战争中损失惨重的宪兵部队最后执行的任务却是非常臭名召著的，那就是准备暗杀毛泽东~但是，问题在于宪兵部队内部思想上产生了分裂，一部分人不愿意同室操戈，反对刺杀；一部分人则坚决执行命令，进行刺杀行动。
最后，进行刺杀的宪兵部队在刺杀行动中被共产党的中央警备团全部歼灭，好像只逃脱了几个人，这几个人后来在国民党那边继续从事特种活动~因为反对刺杀而没有参加行动的那些宪兵部队成员也分成了两派，一派倾向于共产党，最后都去了延安；一派则反对内战，最后两不相帮，保持中立，当了逃兵，脱离了军队。
宪兵部队由于是蒋阶石的卫队，成员挑选很严格，政治上完全国民党化~但是由于宪兵部队士兵素质很高(都是读过书的)，结合社会实际情况，所以思想上很容易倾向共产党，最后竟然在宪兵部队发展了共产党的地下组织，进行活动~~可是由于宪兵部队毕竟比较特殊，宪兵部队的中共地下党组织很快暴露，被国民党一网打尽。据说当时蒋介石非常愤怒~他没想到中共地下党这样无孔不入！！
宪兵部队的中共地下党党员基本上都在南京雨花台被国民党枪杀，现在去雨花台革命烈士纪念馆在一楼最后的一个版块，就是宪兵部队的中共烈士的展区~唉~都很年轻！
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