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　　建议回师苏北，攻打两淮，建立统一的大根据地。1945年8月，日本帝国主义宣布无条件投降后，时任师长的黄克诚率新四军第三师，集结主力，准备担负机动作战任务。此时苏北我军已经先后解放了沐阳、宿迁、泗阳、涟水、阜宁等县城，迫使日伪军纷纷向主要点线集中。而长期盘踞苏北的伪军潘干臣、吴漱泉等部则受国民党的委任，摇身一变，成了国民党军的第六军第二十八师和淮安独立旅，并勾结伪保安团、常备旅等地方反动武装，据守淮阴、淮安，拒绝向我抗日军民缴械投降。面对这种情况，黄克诚决定集中师主力首先攻取两淮，然后攻打盐城，解放苏北全境。

　　然而，新四军军部却命令黄克诚率第三师主力向淮南津浦路西出动，会同第二师谭震林部阻击桂系顽军东犯。黄克诚奉命率部到达指定地区，结果历经半月之久，也未发现国民党军东犯的迹象。黄克诚分析，国民党军队正忙于夺取大城市和交通要道，一时还不大可能向我根据地进攻，而我军主力部队集结于津浦路两侧，旷日持久，势成守株待兔，失去肃清根据地内残敌的有利时机。为此，他和二师政委谭震林商量后，于9月3日联名发电报给华中局和军部并报中央，建议将第二、三师主力调回津浦路东，夺取铁路一段，牵制国民党军；而以主力一部回师苏北，肃清伪军，创造联成一片的大根据地。当日华中局书记饶漱石却回电指示“三师主力不宜调返苏北”。

　　9月5日，刘少奇以中央名义电示华中局，指出“顽军进占大城市与交通要道，我欲阻止顽军前进已很困难或不可能，而桂顽进占城市与要道后，暂时亦不会向我根据地深入进攻我军……在此情况下，请你们考虑黄、谭意见，将三师部队抽调（或再加二师之一部）向东肃清敌伪据点，造成将来作战的有利条件，似乎是必要的，否则主力部队将陷于无事可做的地位。以前黄克诚主张三师部队首先肃清苏北敌伪后再西调的意见似乎也是对的。”据此，黄克诚率第三师主力回师苏北，发起两淮战役，解放了淮阴、淮安城。两淮解放为以后苏中、苏北军区解放苏北最后一座县城盐城创造了有利条件，从此淮南、淮北、苏中、苏北四块根据地联成一片，为即将到来的解放战争准备了有利的条件。
　　
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　　建议迅速抽调十万大军进军东北。1945年9月，黄克诚率新四军三师回师苏北，13日途径华中局驻地时，他看到了中央转发的曾克林向中央汇报东北情况的电报，得悉苏联红军己将日本关东军歼灭并占领我国东北地区，同时我军也有少量部队进入东北，而国民党主力尚在大后方：一时还来不及接管东北。黄克诚认为这是我军进军东北、开辟创建东北战略根据地的极好时机。于是请当时的华中局书记饶漱石给中央发电报，建议中央立即派大部队到东北，不管苏联红军同意与否，要下决心进军东北，不可错过这个时机。但饶漱石不同意发这个电报。黄克诚于是以个人名义于9月14日向中央和军委发电提出他对当前局势的看法及军事方针的建议，其主要内容有：①蒋介石对和谈毫无诚意，只是以此作为欺骗人民、麻痹我军和拖延时间之手段，因此我们不能对和谈抱有幻想，应当立足于打，在与蒋谈判的同时，应集中主力准备决战。②取得联成一片的大战略根据地，有利于进行长期斗争。为此在军事部署上建议应尽量多派部队去东北，至少应有5万人，能去10万人为最好，并派有威望的军队领导人去主持工作，迅速创建东北总根据地，支援关内作战。③关内以晋、绥、察三地区为第一线战略根据地，以山东地区为第二战略根据地，集中主力，消灭敌人。④为执行上述方针，建议从山东调3至5万人去东北，华中应调3至6万人去东北。

　　尽管当时中央已经决定派部队到东北，但调10万人的大部队还是黄克诚在此首先提出的。9月19日，主持中央工作的刘少奇取得当时在重庆与蒋介石谈判的毛泽东的赞同后，为中央起草了《关于目前任务和战略部署》的指示，明确提出了“向北发展，向南防御”的战略方针，并有计划地陆续向东北派遣部队，在很短时间内，使东北我军数量就达到10万人之多，成为我军日后创建东北根据地的基本力量。中央的这一高瞻远瞩的战略部署，包含了黄克诚的正确建议。

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　　建议在东北先建立稳固的根据地，待时机成熟再进行决战。1945年11月，黄克诚率第三师主力抵达锦州附近的江家屯。当时我军进入东北的主要着眼点是占领大城市和铁路干线附近地带，东北局给黄克诚部的命令是负责切断铁路交通钱，阻止国民党军队进入沈阳。黄克诚认真分析了东北敌我的力量和态势，认为我军经连续两个月徒步行军，十分疲劳，加上初到东北，人地生疏，尤其是东北广大群众尚未发动起来，没有根据地作为依托，大部分农村和中小城镇被土匪占领，部队的粮草、被服、弹药供应以及伤病员的安置等都没有着落，而国民党部队正以精锐之师全力猛进。基于这种情况，黄克诚向中央和东北局建议暂时避免与敌人争夺大城市，而把工作重点放在创建广大根据地上。

　　不久，黄克诚与东北局负责人林彪见面，再次重申了“策疲乏之兵，当新羁之马”是不可取的，当前最重要的是建立后方，站稳脚跟，逐渐发展壮大自己，以期将来同国民党军队进行决战，这个意见得到了林彪的赞同。适逢毛泽东来电询问对东北工作所拟采取的方针，黄克诚根据自己的想法草拟电文，提出：我军应进行短期休整，之后以一部主力去占领中小城市，剿灭土匪，建立乡村根据地，积蓄力量，作长期准备。电文经林彪阅后，由黄克诚发给中央。这个建议以及在东北工作的其他领导同志给中央的建议，对于中央制定关于东北发展方针起到了重要作用。12月28日，毛泽东给东北局发出《建立巩固的东北根据地》的著名指示，指出东北斗争的艰巨性，及时地提出了把东北的工作重心放在距离国民党占领中心较远的城乡方面，即“让开大路，占领两厢”，发动群众，建立巩固的根据地，逐步积蓄力量，准备转入反攻。毛泽东的这一重要指示无疑是对黄克诚关于东北问题建议的肯定。