乾隆三十一年（1766年）三月，刘藻因为未能实现乾隆提出的“穷力追擒，捣其巢穴”的战前目标，自杀身亡。没几天，乾隆器重的边境大吏杨应琚（汉军旗人，以大学士衔任云贵总督）到达云南。此时，清军乘缅军撤退之际，至四月先后出边占领缅属整欠、孟艮土司所在地，但缅军一路坚壁清野，清军并无多大收获。清军各留兵八百名并内附掸族土官驻守整欠、孟艮。
清朝云南许多官员因为表面上的军事顺利，主战热情高涨，鼓动杨应琚继续对缅作战。虽然内部也有不少反对意见，认为缅甸声势颇大，不宜擅开边衅。但杨应琚对缅甸局势茫然无知，认为缅甸分为莽匪和木匪两部分，内部分裂涣散，并不足畏。主战派在杨应琚支持下，多方招抚缅属土司，并且发檄文号称“调兵五十万，大炮千樽”大举进军，以威慑缅甸。六月时，乾隆还想着把整欠、孟艮驻兵撤回，不大想继续用兵。因为杨应琚的坚持，猜测乾隆或者还临时翻阅了《明史·云南土司传》，对缅甸蔑视之情油然而生，所以到了七月，乾隆态度变化，正式表态，缅甸在明朝时还是版图之内，并非不可臣服之境，但要求杨应琚少花钱、少用兵就办妥此事。
对缅甸内部局势、与暹罗交战以及缅甸军力如何，乾隆君臣几乎都可以说一无所知，只幻想靠云南万余绿营兵就征服缅甸，可以说颟顸异常。
心热军功的云南文武官员，不等乾隆“圣谕”，就先动起手来。在中国威慑招抚下，七月，缅属蛮暮土司抵阿瓦未回，蛮暮土司母、妻、弟以蛮暮地归降，腾越副将赵宏榜率兵500出铁壁关，轻取蛮暮所属重镇新街（今缅甸八莫）。蛮暮土司自阿瓦回来，也向清军投降。木邦土司不久也正式内附。九月，杨应琚开始调集14000兵准备向缅甸进攻，并先派遣3300兵进驻木邦附近的内地遮放土司，本人也进抵永昌查看情形。
缅军主力虽然深陷暹罗，但留守部队加各地土兵依然不少。在清军发动攻势后，留守阿瓦的缅王孟驳并未惊慌失措，一面严令征暹缅军继续围攻大城，一面派遣将领莽聂渺遮率缅军数千（清方记载为三万，但据各方资料，大约只有六、七千），自阿瓦溯伊洛瓦底江而上与清军对抗，并令落卓土司攻击木邦。九月初，木邦土司无法抵挡，退往清军驻扎的遮放。新街为中缅边境重镇，扼水陆之要冲，水路顺流而下，四五日就可到达缅都阿瓦，为双方必争之地。这时边境已经警报四起，但杨应琚依然只派永顺镇都司刘天佑、腾越镇都司马拱垣率400余兵支援赵宏榜，援兵九月七日到达新街，清军总数依然不足千人。九月二十四日，数千缅军乘船抵达新街，迅即对清军发动攻击。双方兵力悬殊，清军坚持两日一夜，宣告不支，刘天佑战死，赵宏榜率残军由小道突围，退入铁壁关。蛮暮土司也率众退入云南。
杨应琚紧急调集各镇营兵赴援，命东路永顺镇总兵乌尔登额带兵至宛顶（今云南畹町），打算进攻木邦。西路永北镇总兵朱仑带兵进驻铁壁关，打算进攻蛮暮以复新街。缅军部署却出乎清军意料，缅军在新街分兵两路，主力沿东北方进入中国境内，在铁壁关外楞木驻扎。另一路二千余人继续沿伊落瓦底江北上，抵达戛鸠后，东向攻入中国境内，再南下截断铁壁关清军后路。
清军对此丝毫不知，云南提督李时升于十一月十五日抵达铁壁关，第二日，命朱仑率4000余兵出关攻击。十七日，朱仑抵达楞木，在高处扎营。十八日，缅军主动发动攻势，清军虽然居高临下，但装备的基本是火绳枪，射速既慢，向下射击时，弹药又往往未发就先掉下。而缅军装备的多是燧发枪（来自英、法等国，途径很多，或送、或买、或抢），射速、火力、对环境的适应都远胜清军。结果双方交战四日，大家都互有死伤。但清军伤亡较大，首先感觉支持不住，急忙求援。提督李时升拨宛顶兵700名赴援。但清军战况依然不利，缅军树立营栅，逐渐逼近清军大营。二十三日起，清军坚壁不出。双方暂时休战。楞木缅军全数也不到六千，朱仑却以杀敌六千，取得楞木大捷上报。
战争不是靠言语打胜的。十一月二十日，缅军绕道戛鸠的北路兵二千余人，由万仞关、巨石关间攻入守备薄弱的腾越境内，仅仅十天时间，先后攻占盏达、铜壁关，清军死伤数百，游击班第战死，战火蔓延至户撒、腊撒地带，严重威胁铁壁关后路。知道缅军由万仞关攻入后，清军开始手忙脚乱。提督李时升命游击马成龙带兵900名由户撒攻击前进，又令驻南甸的临沅镇总兵刘德成率所部2100兵自后夹击。但刘德成到达木崖后，迁延不前。马成龙率部徒涉渡江时，水深没腰，火药皆湿。缅军伏兵突起冲杀，马成龙阵亡，除未及渡江的70余人，八百余兵死伤殆尽。十二月，北路缅军渡江进入户撒地带，李时升先后调2800兵至户撒抵御，双方交战不多，缅军看清军越来越多，干脆脱离接触，退往铜壁关。绿营又以大捷上报。
缅军虽然屡战屡胜，但也很清楚本国军队主力远在暹罗，长期与中国抗衡，压力沉重。所以，作战目标很明确，就是以战逼和。于是，在楞木前线，缅将莽聂渺遮请求议和，但清军要求缅甸递交降表，谈判破裂。不久，楞木及铁壁关清军被北路缅军严重威胁后路，清军狼狈撤至陇川。缅军主力四千余人入铁壁关，进军陇川。
在陇川，两军再次爆发大战。十二月十六日，缅军先锋攻击前进，被大队清军围困。第二日，缅军主力进援，双方接战后，缅军骑兵突于丛林冲出，被围的缅军先锋也乘机冲杀出来，清军崩溃，一路溃逃而回，兵员虽然丧失不多，但军械枪炮丢弃很多，而总督杨应琚仍以克捷奏闻。云南提督还想调兵三面围攻，但实在力不从心，无法有效组织反攻了。杨应琚也由从前的雄心壮志转为胆战心惊，赶紧派人到陇川命令朱仑与缅军议和。缅军十二月二十六日提出谈判的时候，朱仑派参将哈国兴接受对方条件，双方停战，蛮暮、新街等地仍归缅甸。二十八日，缅军主力开始撤兵，打算取道猛卯转回木邦。北路缅军由铜壁关取道铁壁关，转回新街。
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