在台湾，除监察和保防重回政战外，据了解，过去三年遭裁并的国防部人力司和物力司、军法司和法制司等单位，以及原本已经并入联勤的三军后勤系统，在2008年元旦起也将复编或复归原先体制。简单来说，过去遭国防部前部长李杰大刀变革的国防组织，在现任部长李天羽接手后已决定全部复原。据《中国时报》报道，至于在人事方面，军方高层说，和李杰相比，外界可以看出李天羽在人事上的安排手法温和许多，特别是对李杰的旧属，李天羽也待之以礼，并没有如外界预料的逼退动作，或如同当年李杰对李天羽人马的赶尽杀绝。

　　军方人士举例说，像是海军的总政战局长陈国祥、军备局长吴伟龙、战规司长董翔龙等，都曾经是李杰的爱将，李天羽部长还是一样重用，而李杰的重要幕僚、海军舰队司令李仲威也干的好好的，李天羽上任已经半年，到现在也没有因而换人。另国防部高层也强调，李天羽的做法是基于让国防部组织得以回归“国防二法”精神，绝非推翻李杰的努力，而是希望依法行政，因此像是被外界质疑的军中黑机关如联侦中心等就宣告裁撤，而李杰时代设立的督察室也将回归内部稽核的本务。 高层官员说，在李杰部长时代，有许多组织调整完全是一时兴起，只能说李杰“很有魄力”，例如因李杰一度认为原本隶属参谋本部联二情报系统的驻外武官联系很重要，不经思考就指示将联二的国际情报处纳编给经常离台开会的国防部战略规划司，但试行一段期间后发现问题丛生，两三个月后又回归联二系统。

　　又像是将联勤司令部所属七个处简并成两个处，当时不顾一切就先裁掉将官缺额，赶走一堆人后，才发现问题严重，在决策前根本也没有详尽的参谋作业，事后发现问题也无法补救。目前国防部已经检讨，将重新在三军设置联勤指挥部，由军种少将负责各军的后勤执行事宜，以挽救战时将会出现严重问题的台军后勤体系。 至于人员精简部分，高层官员表示，李天羽5月20日上任迄今，走访各级单位，发现问题相当严重，例如外岛的士官编配比，仅达40%，也就是10个士官职务有6个是缺员，加上役期持续缩短，无论基层或中阶干部，均反应精进案执行后，任务繁重更甚以往，因此才会决定回归国防组织原本体制。

　　冰冻近三年 政战大复活 重掌监察保防

　　原本已经名存实亡的台军政战系统，在遭冻近三年后，经国防部重新检讨，已确定将先前纳入督察和情报系统的监察（政三）和保防（政四）大权重新回归政战局主掌，并在2008年元月起正式恢复运作，国防部政战局甚至从先前的5处反扩增为7处，台军政战制度又再度宣告复活。 而由前部长李杰主导学习美军督察体系的台军督察制度，在国防部督察室移出监察处和保防处之后，虽仍保留内部稽核的功能，但因尚方宝剑已被收回，过去三年军中闻声就怕的督察系统等于手脚尽废，据了解，被视为李杰旧属的督察室主任王春江近期也传出将被调职。

　　据透露，由于王春江在李杰时代“不留情面、只问是非”，在多次大挥“军纪虎头铡”后，早已得罪不少人，李杰下台后王春江更已无人力挺；而新任部长李天羽也将其视为前朝人马，因此准备将其调离职务，让王春江“功成身退”。

　　另一方面，近期军中内部不断传出，为在必要时通过台军后备系统动员辅选，层峰一度考虑由政战出身的现任政战局长陈国祥接任一向由兵科出任的后备司令职务，但因军中内部反弹过大因而暂缓。对此陈国祥也强调“绝不可能”，陈国祥说：“政战局长绝对是我最后一个职务！”台军政战体系，李杰在三年前藉八军团地下钱庄弊案，顺势抽走最重要的监察和保防大权，加上位阶调降，几乎已名存实亡，国防部随后并成立督察室，分别和情报次长室主管政三、政四，以削弱政战权力，同时将这两项掌管部队的重要权力收归国防部长手中。 然据了解，三年来因这套体系调整，在军中内部持续产生不少争议，有军中将领就透露，由于督察室并非国防部组织法中律定的单位，却能以一个“黑机关”的身份掌握军中的尚方宝剑，对各单位进行督察，甚至砍掉不少人，有不少遭调查的军中人士，事后都因此提出行政诉讼，认为相关调查的合法性有严重问题。