据日本媒体报道  ，正在日本访问的澳大利亚外长斯蒂芬·史密斯１月３１日和２月１日在东京分别与日本外相高村正彦和执政的自民党政调会长谷垣祯一举行会谈。双方一致认为，不应使日本船只在南极洲附近海域捕鲸的问题对两国关系造成负面影响。高村在会谈中表示，两国专家有必要在科学基础上进行冷静讨论，不应使捕鲸问题影响两国友好关系。他要求澳方对环保人士的行动采取适当的应对措施。 史密斯说，澳政府和人民认为日本的“科研捕鲸”活动是没有必要的。他同时说，环保组织阻止日本船只捕鲸的行动与澳政府无关。

　　谷垣在会谈中说，捕鲸问题是两国间的唯一问题，两国人民对捕鲸的看法有所不同，不能让这一问题影响两国友好关系。 此外，日本首相福田康夫２月１日在会见史密斯后也表示，各国在捕鲸问题上因国情不同而有不同立场，不应因此影响外交关系。日澳双方应将捕鲸作为单独的问题，冷静地进行处理。 另外，两国外长在１月３１日的会谈中同意今年在澳大利亚举行由外交部长和国防部长参加的“２＋２”会谈。去年以来，日澳两国加强了在安保领域的合作。去年３月，时任日本首相的安倍晋三同澳大利亚当时的总理霍华德在东京签署日澳安全保障联合宣言。６月，双方在东京首次举行由外交部长和国防部长参加的“２＋２”安全保障磋商。

　　史密斯是１月３１日抵达日本访问的。３１日当天，两国还签署了新的日澳租税条约。新条约旨在促进两国经济交流，与现行租税条约相比，降低了对投资收益和专利使用费等的征税额。