双方确认，支持中日民间绿化合作委员会的工作，进一步推进日本民间团体等在华植树造林合作事业，并在可持续森林经营方面开展合作。
2、农业合作
双方就积极开展农业领域合作达成一致。中方表示同意进口符合中国检疫标准的日本大米，日方对此表示欢迎。双方将继续积极协商相互进出口农产品问题。
3、朱鹮
中方同意向日本提供两只朱鹮，日方对此表示感谢。双方同意开展朱鹮保护合作。
4、医药领域合作
双方同意推进以应对新型流感和癌症为重点的中日医学合作构想。关于癌症防治合作，日方表示将尽早派遣由官方和民间有关人员组成的代表团到中国交流，中方对此表示欢迎。
5、知识产权
双方同意，在相互尊重、互利共赢的基础上，加强知识产权领域的对话与合作，共同促进知识产权运用与保护水平的不断提高，以推动两国经济关系顺利发展。
6、中小企业博览会
日方同意应邀作为主宾国与中方共同主办将于9月在广州举办的中小企业博览会。
7、信息通信技术领域合作
双方同意，进一步加强和推动双方在下一代移动通信和下一代网络等信息通信领域的合作。
8、金融领域合作
双方同意，进一步加强在金融和金融监管领域的合作关系。
9、刑事司法领域合作
双方同意，作为加强中日在刑事司法领域合作关系的重要一环，将努力争取年内关于缔结中日刑事司法协助条约的谈判达成实质性共识。双方同意继续推进关于缔结中日引渡条约和被判刑人移管条约事项的磋商。
（三）地区和国际事务合作
1、联合国改革
双方同意就联合国改革问题加强对话与沟通，努力增加共识。中方愿意看到日本在国际事务中发挥更大的建设性作用。
2、六方会谈合作
双方再次确认，根据2005年9月19日六方会谈共同声明推进六方会谈进程，通过对话与协商，共同合作致力于实现朝鲜半岛无核化，维护东北亚地区的和平与稳定。双方一致认为，六方应共同努力，全面落实2007年2月13日六方会谈关于起步阶段行动的共同文件。日方就解决包括绑架问题在内的日朝间悬案、推进日朝邦交正常化谈判的方针作了说明。中方对日本国民有关人道主义关切表示理解和同情，希望这一问题早日得到解决，期待日朝关系取得进展，愿为此提供必要协助。
3、投资交流
双方同意，为尽早达成一个务实共赢的中日韩投资协议和制定中日韩改善商务环境行动计划作出努力。
4、经济合作
双方一致认为，将于2008年结束的日本对华日元贷款为中国经济建设和中日经济合作发挥了积极作用，中方对此表示感谢。双方同意就合作向第三国提供援助问题进行对话。
六、为妥善处理东海问题，双方达成以下共识：
（一）坚持使东海成为和平、合作、友好之海。
（二）作为最终划界前的临时性安排，在不损害双方关于海洋法诸问题立场的前提下，根据互惠原则进行共同开发。
（三）根据需要举行更高级别的磋商。
（四）在双方都能接受的较大海域进行共同开发。
（五）加快磋商进程，争取在今年秋天就共同开发具体方案向领导人报告。
七、双方对设立“处理日本遗弃在华化学武器日中联合机构”表示欢迎。为加快销毁进程，日方表示将根据中方提议引进移动式处理设备进行作业，中方对此表示欢迎。
八、中方对日方在温家宝总理访日期间所给予的热情友好接待表示感谢。
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